20 сентября 1994 года ознаменовало важное событие для Ингушетии — состоялось торжественное открытие Ингушского государственного университета (ИнгГУ), первого в республике вуза. Это решение было принято еще раньше, 23 апреля того же года, когда было издано Постановление Правительства Российской Федерации №380 «Об образовании Ингушского государственного университета» Архивная служба.
С момента открытия университет разместился в здании бывших казарм ставропольского лётного училища, расположенном в станице Орджоникидзевской (ныне — город Сунжа). В 1997 году был построен новый корпус в селе Гамурзиево, а в 2001 году — в Магасе. К 2016 году завершилось строительство нового главного корпуса в Магасе, что стало важным шагом в развитии образовательной инфраструктуры региона.
Ингушский государственный университет стал основой для системы высшего образования в республике. Первым ректором вуза был Азамат Арсамакович Мальсагов, который возглавлял его с 1994 по 1999 год. На данный момент ректором ИнгГУ является доктор философских наук, профессор Албакова Фатима Юсуповна.
За почти три десятилетия своего существования университет зарекомендовал себя как один из ключевых образовательных и научных центров региона, активно участвуя в подготовке кадров и способствуя развитию республики.